Projet d'amorce - Establishment of a longitudinal detection methodology for filoviruses in fruit bats in Rwanda

Depuis plusieurs décennies, les filovirus, dont les virus Ebola et Marburg, provoquent des épidémies meurtrières en Afrique, avec des impacts sanitaires et économiques majeurs. En 2024, le Rwanda a connu la troisième plus grande flambée de Marburg de l’histoire, maîtrisée grâce à une mobilisation rapide des autorités et des partenaires internationaux. L’épidémie a révélé la nécessité d’un suivi renforcé des réservoirs naturels, notamment les chauves-souris frugivores, connues pour héberger ces virus. Ce projet pilote, mené conjointement par le Center of One Health Genome Dynamics and Biodiversity Conservation (COGEBI), l’Université du Rwanda et l’Université de Liège, vise à établir une méthodologie de surveillance longitudinale des filovirus dans les populations de chauves-souris au Rwanda. Pendant deux ans, des échantillons seront collectés sur plusieurs sites et analysés par des approches sérologiques, génomiques et de neutralisation virale. Les données permettront d’identifier les souches circulantes, d’évaluer leur dynamique saisonnière et de proposer des stratégies de prévention intégrées au plan national de préparation aux pandémies, avec une perspective d’extension régionale. Le projet a pour ambition de vérifier si une surveillance continue des chauves-souris à l’aide d’outils moléculaires peut contribuer à prévenir les épidémies de filovirus au Rwanda et dans les pays voisins. Il s’articule autour de trois objectifs spécifiques : concevoir un protocole sûr et éthique de prélèvement sur les chauves-souris, détecter et caractériser sur le long terme la présence de filovirus dans ces populations, et proposer une stratégie de réponse préventive contre les maladies qu’ils provoquent, telles que la maladie à virus Ebola et la maladie à virus Marburg. Les résultats serviront à orienter les politiques publiques et à renforcer la position du Rwanda comme pôle régional de surveillance et de lutte contre les zoonoses à haut risque.